Es gibt einige Erkrankungen, bei denen eine medizinische Hypnosetherapie nicht angewendet wird. Das ist der Fall bei Wahnvorstellungen oder Halluzinationen und bei Krankheiten, die eine Eigen- oder Fremdgefährdung auslösen können. Auch eine Selbstmordgefährdung schließt eine Hypnosetherapie aus.
Genauso kann eine psychotherapeutische oder medizinische Behandlung nicht durch eine Hypnosetherapie ersetzt werden. Aber sie kann diese positiv begleiten.